Soukyuu no Fafner: Dead Aggressor – Heaven and Earth Saat itu tahun 2148. Dua tahun setelah Fafner asli dalam serial TV Azure berakhir, Pulau Tatsumiya dan penduduknya yang masih hidup telah kembali ke pemulihan. Namun, pahlawan kita putus asa, Kazuki; hampir buta sekarang, dan sebagian lumpuh dari pertempurannya dengan Festum dua tahun sebelumnya, dia berpegang teguh pada janji yang dibuat oleh Soushi, temannya yang jatuh, untuk kembali ke pulau itu dan memperbaiki keadaan lagi.
Harapan Kazuki berkobar ketika bentuk kehidupan terdeteksi di dalam kapal tak berawak yang datang mengambang ke Teluk Tatsumiya suatu malam, tetapi orang di dalamnya bukanlah Soushi; itu adalah “anak laki-laki” misterius bernama Misao Kurusu yang mungkin tak sepenuhnya manusia, dan yang mengaku telah dikirim oleh Soshi. Dengan kedatangan Misao, permusuhan pecah lagi antara Tentara Manusia dan Festum, dan pilot Fafner terjebak dalam pertempuran paling putus asa dalam hidup mereka – kali ini, dengan nasib DUA ras menunggangi bahu mereka.