Sora no Aosa wo Shiru Hito yo (Her Blue Sky) berpusat pada siswa SMP Aoi Aioi yang tinggal bersama kakak perempuannya Akane. Pasca kecelakaan tragis yang membuat orang tua mereka meninggal 13 tahun yang lalu, membuat mereka hidup bersmaa. Karena sang kakak yang selalu menjaga dan merewatnya sendirian sejak kecelakaan tersebut membuat ada rasa tidak enak di diri Aoi. Yap dia membulatkan hati ingin pindah ke Tokyo setelah lulus untuk meringankan beban saudara perempuannya dan mengejar karir musiknya. Terinspirasi oleh mantan pacarnya Akane, Shinnosuke “Shinno” Kanamuro. Shinno adalah bagian dari sebuah band sampai ia berangkat ke Tokyo untuk menjadi seorang bassis profesional setelah orang tua kedua saudari itu meninggal, dan ia tidak pernah terlihat lagi.
Suatu sore, ketika Aoi berlatih gitar di wisma, ia dikejutkan oleh Shinno versi 18 tahun dari 13 tahun yang lalu! Seolah secara kebetulan, Shinno yang saat ini berusia 31 tahun juga kembali ke kota, tetapi ia telah berubah secara drastis. Sekarang ada dua Shinno yang ada, tetapi mengapa Shinno dari masa lalu hadir?
Sora no Aosa wo Shiru Hito yo berputar di sekitar empat individu ini ketika mereka menghadapi perasaan batin mereka terhadap satu sama lain dan membuat keputusan yang akan mempengaruhi kehidupan mereka dari sini.