Ro-Kyu-Bu! bercerita tentang permainan yang sangat tidak di duga! Hasegawa Subaru bergabung dengan klub bola basket di SMA Nanashiba, tapi klub nya pun di hentikan sementara karena terkena kasus yang cukup berat dan membuat dewan guru marah sehingga dirinya pun tidak bisa melalukan kegiatan klub selama setahun.
Tapi dia pun di tawari sebuah pekerjaan oleh Bibi nya yang merupakan Guru di sekolah dasar untuk melatim tim basket perumpuan yang ada di sekolahnya. Karena di paksa Subaru pun melatih 5 orang anak-anak untuk bisa bermain basket dan supaya klub basket mereka tidak di buburkan oleh sekolah karena belum ada prestasi yang di dapat. Dalam kasus ini Subaru menghadai hal yang sama seperti kasus di klub nya tapi ada satu hal yang membuatnya tertarik melatih klub basket putri di sd tersebut yaitu semangat dan permainan indah Minato Tomoka yang sangat menyukai bermain basket seperti dirinya. Apakah Subaru dapat mempertahankan klub tersebet? Atau klub yang dia bimbim tersebut akan hancur seperti klub nya di sekolahnya?
