Nana anime in berkisah tentang 2 orang gadis yang memiliki nama depan yang sama tapi memeliki sifat yang saling bertolak belakang satu sama lain .
Yang pertama adalah Nana Komatsu adalah seorang gadis yang selalu jatuh cinta pada pandangan pertama kepada setiap orang yang dianggapnya “perfect”. Suatu hari dia diputuskan pacarnya, dia sangat marah dan kesal, dan menganggap dirinya hanya sebagai mainan. Dia pun juga harus berpisah dengan sahabatnya, Junko, yang memutuskan untuk pergi ke Tokyo. Tak lama kemudian, dia mendapatkan pacar baru bernama Shoji yang sangat perhatian padanya yang harus juga ke Tokyo karena bekerja.
Lalu yang kedua Nana Osaki adalah seorang gadis punk atau emo yang terlihat tangguh dan kuat. Sebenarnya hatinya rapuh. Nana adalah vokalis band Blast yang beraliran Rock terkenal di kotanya. Dia berpacaran dengan sang basis, Ren. Setelah beberapa tahun bersama, Ren memutuskan untuk keluar dari Blast, dan menerima undangan menjadi basis band terkenal Trapnest di Tokyo. Ren pun pergi. Band Blast pun hancur.
Nana Komatsu memutuskan naik kereta untuk pergi ke Tokyo. Disana dia duduk bersebelahan dengan Nana Osaki yang bertampang rocker! Mereka pun berbincang-bincang untuk menunggu kereta sampai di Tokyo. Secara kebetulan lagi, ketika sedang mencari tempat tinggal, mereka berdua bertemu disebuah kamar no.707 (dalam bahasa Jepang, Nana berarti “tujuh”). Untuk mempermurah harga sewa, mereka pun memutuskan untuk tinggal berdua.
Lama-kelamaan mereka sudah sepeti sahabat atau lebih tepatnya kakak dan adik, walaupun umur mereka sama. Mereka saling melindungi satu sama lain. Konflik yang mereka miliki satu sama lain menjadi saling berhubungan. Dan disini lah kehidupan mereka berdua satu sama lain saling berhubungan dengan berbagai konflik yang ada di sekitar mereka masing .
