Dengan Kejuaraan Interhigh akhirnya berakhir, tim basket Seirin memfokuskan kembali upaya mereka, berlatih lebih keras dari sebelumnya untuk mendapatkan kesempatan untuk berpartisipasi dalam Piala Musim Dingin. Baik Tetsuya Kuroko dan Taiga Kagami melihat teman-teman lama berjalan kembali ke kehidupan mereka, memberikan tantangan baik di dalam maupun di luar lapangan.
Ketika keterampilan baru dikembangkan dan aliansi baru dibuat, musuh dari berbagai tim — raksasa bola basket sekolah menengah seperti Yousen, Shuutoku, dan Touou — menghalangi upaya teguh Seirin untuk mencapai puncak. Semua sekolah ini terbukti menjadi musuh tangguh yang kemampuannya berkembang secara eksponensial, sementara Kuroko berjuang untuk menemukan keseimbangan antara tekadnya untuk bermain sebagai bagian dari tim dan keinginannya untuk menang.
Dengan luka lama yang terbuka kembali, tantangan baru yang harus dihadapi di lapangan, dan serangkaian musuh baru — “Raja Tanpa Mahkota” — bersumpah untuk mengalahkan calon baru, akankah Seirin dapat mencapai impian mereka untuk mengalahkan Generasi Keajaiban?