Season 1-2 jadi 1 disini.
Juubee-chan: Lovely Gantai no Himitsu Jiyu Nanohara seorang siswi smp tiba-tiba mengetahui bahwa dirinya adalah penerus dari Tuan Yagyu Jubei seorang Samurai yang sangat hebat pada masanya, pada awalnya Jubei (panggilan ayahnya) selalu berusaha menolak kenyataan ini dengan membuang tutup mata yang akan merubahnya menjadi Yagyu Jubei, padahal benda ini sangat diperebutkan oleh perguruan lain, tapi setelah melalui berbagai kejadian akhirnya diapun dapat menerima kenyataan ini.
Juubee-chan 2: Siberia Yagyuu no Gyakushuu Tiga ratus tahun yang lalu, di tanah dingin Siberia, Jubei Yagyu terlibat dalam pertempuran sengit dengan Kitaretsusai dari klan Yagyu Utara. Duel itu mahal, karena putrinya Freesia dibekukan dengan hukuman mati. Sebagai hasil dari pemanasan global di masa kini, Freesia melepaskan diri dari kuburannya yang sedingin es dan pindah ke Jepang sebagai siswa transfer sekolah menengah, di mana dia berteman dengan Jiyuu Nanohana. Sedikit yang Jiyuu tahu bahwa Freesia menargetkan dia untuk mendapatkan Lovely Eye Patch yang didambakan, yang menurut Freesia adalah haknya.