berpusat pada Masaru siswa SMP tahun kedua dan sorang preman jalanan yang tak terkalahkan , akan mempelajari arti kata “kerja tim” . Setelah Agumon lolos dari DATS , sebuah organisasi yang berurusan dengan Digimon , dia berkelahi dalam pertempuran dengan Masaru . Segera Yoshino dan Lalamon datang untuk menangkap Agumon , dan kedua pejuang tersebut melarikan diri . Setelah Digimon jahat muncul , terserah pada Masaru dan Agumon untuk mengalahkannya dengan DNA Charge mereka .
Masaru harus segera bergabung dengan DATS untuk mengakhiri Digimon yang datang ke Bumi . Dengan bantuan Yoshino , Ikuto , dan Touma , kelompok tersebut harus menghentikan Digimon jahat yang muncul dan mengembalikannya ke Digital World.
