Para Penjaga Pelaut dan pemimpin mereka, Sailor Moon, melanjutkan tugas mereka untuk melindungi Bumi dari siapa pun yang berani membahayakannya. Namun, visi apokaliptik Sailor Mars dan munculnya dua penjaga baru—Sailor Neptune dan Sailor Uranus—menandakan bahwa pertempuran baru akan segera dimulai.
Para pendatang baru ini mencari tiga Jimat yang ada di dalam Kristal Hati Murni di dalam diri manusia. Setelah disatukan, benda-benda ini membentuk The Holy Grail, peninggalan magis dengan kemampuan luar biasa. Mereka ingin menggunakan Cawan untuk menyelamatkan dunia, tetapi sebuah organisasi jahat yang dikenal sebagai Death Busters mencari kekuatannya untuk keinginan mereka sendiri.
Penghapusan Jimat dari Kristal Hati seseorang akan menyebabkan kematian mereka, sesuatu yang dilihat Uranus dan Neptunus sebagai pengorbanan yang diperlukan untuk membentuk Cawan, sementara Sailor Moon dan kelompoknya menganggapnya tidak bisa dimaafkan. Tetapi dapatkah pengorbanan apa pun sepadan dengan biayanya jika itu menyelamatkan nyawa seluruh umat manusia?