Chiyo Mihama memulai karir sekolah menengahnya sebagai salah satu siswa paling aneh di kelas mahasiswa barunya—keajaiban akademis kecil berusia 10 tahun dengan kegemaran akan boneka mewah dan masakan buatan sendiri. Tapi wali kelasnya, Yukari Tanizaki, adalah tipe orang yang akan membajak sepeda siswa agar tidak terlambat, jadi “aneh” adalah kata yang relatif.
Tentu saja tidak ada kekurangan gadis-gadis aneh di kelas wali kelas Yukari-sensei. Menemani Chiyo adalah siswa seperti Tomo Takino, seorang tomboi energik dengan lebih antusias daripada otak; Koyomi Mizuhara, sahabat Tomo yang temperamennya memiliki sekering lebih pendek dari Chiyo; dan Sakaki, kecantikan atletis tinggi yang penampilannya mengintimidasi menyembunyikan kepribadian yang lembut dan obsesi yang menyakitkan dengan kucing. Selain itu, murid pindahan Ayumu Kasuga, seorang gadis dengan kepala tersangkut di awan, cocok dengan gadis-gadis lainnya — dan dia memiliki beberapa teori menarik tentang kuncir Chiyo!