Yukito Kunisaki sedang dalam perjalanan mencari Winged Maiden yang terikat ke langit berabad-abad yang lalu, setelah mendengar kisah masa kecil lama dari ibunya. Ketika Yukito menunjukkan pertunjukan bonekanya kepada orang-orang dalam upaya untuk menghasilkan uang, dia menemukan dirinya di sebuah kota kecil di mana dia tidak berharap untuk tinggal lama. Namun, ketika dia bertemu dengan seorang gadis yang tidak biasa bernama Misuzu, hal-hal berubah drastis saat dia diundang untuk tinggal bersamanya.
Dengan tinggal di kota kuno, Yukito segera menjadi teman dengan penduduk setempat. Saat dia mengenal mereka dengan lebih baik, dia belajar dari masalah mereka dan memutuskan untuk membantu, menunda pencariannya untuk Winged Maiden. Dengan pencariannya ditahan, dan keterikatannya yang semakin besar dengan Misuzu dan kota kecil itu, akankah Yukito menemukan Winged Maiden, atau apakah dia lebih dekat dari yang dia kira?